Jika tidak ditangani, lupus dapat menyebabkan beragam komplikasi, seperti:
- Kerusakan ginjal, salah satunya berujung pada gagal ginjal
- Gangguan pada sistem saraf atau otak, misalnya kejang
- Gangguan pada darah, seperti peradangan pembuluh darah (vaskulitis)
- Gangguan pada paru-paru, seperti pleuritis
- Gangguan pada jantung, seperti perikarditis
- Rentan mengalami penyakit infeksi
- Avaskular nekrosis atau kematian jaringan tulang
Penderita lupus harus berkonsultasi dulu dengan dokter sebelum merencanakan kehamilan, karena lupus dapat menyebabkan komplikasi pada kehamilan, seperti keguguran, kelahiran prematur, preeklamsia, dan gangguan jantung pada janin.