Anemia defisiensi besi dapat menimbulkan komplikasi yang berbahaya jika tidak segera diobati. Beberapa komplikasinya adalah:

  • Masalah jantung, seperti gangguan irama jantung yang dapat memicu kardiomegali atau gagal jantung
  • Komplikasi kehamilan, kelahiran prematur, atau berat badan lahir yang rendah pada bayi jika anemia terjadi pada ibu hamil
  • Depresi

Pada bayi atau anak-anak, anemia defisiensi besi parah juga dapat menimbulkan komplikasi berupa tumbuh kembang yang lambat. Selain itu, bayi atau anak-anak yang menderita anemia defisiensi besi juga lebih rentan terkena infeksi.